Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

(Back to Minerals by class)

114 Gibbsite (Al(OH)3)

(Previous)     (Back)     (Next)
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     9.74  10.16   4.34  90.00  85.46  90.00    428.0   2.421
                                       PM6:     9.04  10.38   4.45  90.07  89.98  89.97    417.3   2.483
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 1SCF MERS=(1,1,2)
      Gibbsite

  H              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Al             -0.84900000 +1    1.8870000 +1    3.6270000 +1                  0.0000
  O             -2.12400000 +1    2.8760000 +1    2.5680000 +1                  0.0000
  O              0.65400000 +1    2.4350000 +1    2.6370000 +1                  0.0000
  O             -3.85100000 +1    4.9630000 +1    2.6130000 +1                  0.0000
  O             -1.09400000 +1    0.3340000 +1    2.6290000 +1                  0.0000
  H             -2.78200000 +1    2.5390000 +1    2.4470000 +1                  0.0000
  H              0.75900000 +1    2.4630000 +1    1.8060000 +1                  0.0000
  H             -3.92400000 +1    5.8340000 +1    2.6120000 +1                  0.0000
  H             -1.06000000 +1    0.3650000 +1    1.7480000 +1                  0.0000
  O             -0.96100000 +1    3.5150000 +1    4.6430000 +1                  0.0000
  H             -0.31400000 +1    3.9350000 +1    4.6010000 +1                  0.0000
  O             -2.26500000 +1    1.0100000 +1    4.6350000 +1                  0.0000
  H             -2.29500000 +1    0.9550000 +1    5.4940000 +1                  0.0000
 Al             -5.21500000 +1    4.1560000 +1    3.6720000 +1                  0.0000
 Al              2.02300000 +1    1.6470000 +1    3.6730000 +1                  0.0000
  O              3.29800000 +1    0.6580000 +1    4.7320000 +1                  0.0000
  O              0.52000000 +1    1.0990000 +1    4.6630000 +1                  0.0000
  O             -3.65900000 +1    3.6490000 +1    4.6870000 +1                  0.0000
  O              2.26800000 +1    3.2000000 +1    4.6710000 +1                  0.0000
  H              3.95600000 +1    0.9950000 +1    4.8530000 +1                  0.0000
  H              0.41500000 +1    1.0710000 +1    5.4940000 +1                  0.0000
  H             -3.58600000 +1    2.7780000 +1    4.6880000 +1                  0.0000
  H              2.23400000 +1    3.1690000 +1    5.5520000 +1                  0.0000
  O              2.13500000 +1    0.0190000 +1    2.6570000 +1                  0.0000
  H              1.48800000 +1   -0.4010000 +1    2.6990000 +1                  0.0000
  O              3.43900000 +1    2.5240000 +1    2.6650000 +1                  0.0000
  H              3.46900000 +1    2.5790000 +1    1.8060000 +1                  0.0000
 Al             -2.29500000 +1    4.4560000 +1    3.6270000 +1                  0.0000
 Al              2.43200000 +1    1.6170000 +1   -1.2260000 +1                  0.0000
 Al             -4.80600000 +1   -0.8920000 +1   -1.2270000 +1                  0.0000
  O              2.60300000 +1    3.1970000 +1   -2.2850000 +1                  0.0000
  O             -3.30300000 +1   -1.4400000 +1   -2.2170000 +1                  0.0000
  O              0.87700000 +1    1.1100000 +1   -2.2400000 +1                  0.0000
  O              3.63400000 +1    0.6610000 +1   -2.2240000 +1                  0.0000
  H              1.94500000 +1    3.5340000 +1   -2.4070000 +1                  0.0000
  H             -3.19700000 +1   -1.4680000 +1   -3.0470000 +1                  0.0000
  H              0.80300000 +1    0.2390000 +1   -2.2420000 +1                  0.0000
  H              3.66800000 +1    0.6300000 +1   -3.1060000 +1                  0.0000
  O              3.76700000 +1    2.5580000 +1   -0.2100000 +1                  0.0000
  H              4.41400000 +1    2.1380000 +1   -0.2520000 +1                  0.0000
  O              2.46300000 +1   -0.0150000 +1   -0.2180000 +1                  0.0000
  H              2.43300000 +1    0.0400000 +1    0.6410000 +1                  0.0000
 Al             -0.48700000 +1    1.9170000 +1   -1.1810000 +1                  0.0000
 Al             -1.93300000 +1   -0.6520000 +1   -1.1800000 +1                  0.0000
  O             -0.65800000 +1    0.3370000 +1   -0.1210000 +1                  0.0000
  O             -3.43600000 +1   -0.1040000 +1   -0.1900000 +1                  0.0000
  O              1.06800000 +1    2.4240000 +1   -0.1670000 +1                  0.0000
  O             -1.68800000 +1    2.8730000 +1   -0.1820000 +1                  0.0000
  H             -3.54200000 +1   -0.0760000 +1    0.6410000 +1                  0.0000
  H              1.14200000 +1    3.2950000 +1   -0.1650000 +1                  0.0000
  H             -1.72300000 +1    2.9040000 +1    0.6990000 +1                  0.0000
  O             -1.82100000 +1    0.9760000 +1   -2.1960000 +1                  0.0000
  H             -2.46900000 +1    1.3960000 +1   -2.1540000 +1                  0.0000
  O             -0.51700000 +1    3.5490000 +1   -2.1880000 +1                  0.0000
  H             -0.48700000 +1    3.4940000 +1   -3.0470000 +1                  0.0000
  H              0.00000000 +1    5.0780000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Al             -0.84900000 +1    6.9650000 +1    3.6270000 +1                  0.0000
  O             -2.12400000 +1    7.9540000 +1    2.5680000 +1                  0.0000
  O              0.65400000 +1    7.5130000 +1    2.6370000 +1                  0.0000
  O             -3.85100000 +1   10.0410000 +1    2.6130000 +1                  0.0000
  O             -1.09400000 +1    5.4120000 +1    2.6290000 +1                  0.0000
  H             -2.78200000 +1    7.6170000 +1    2.4470000 +1                  0.0000
  H              0.75900000 +1    7.5410000 +1    1.8060000 +1                  0.0000
  H             -3.92400000 +1   10.9120000 +1    2.6120000 +1                  0.0000
  H             -1.06000000 +1    5.4430000 +1    1.7480000 +1                  0.0000
  O             -0.96100000 +1    8.5930000 +1    4.6430000 +1                  0.0000
  H             -0.31400000 +1    9.0130000 +1    4.6010000 +1                  0.0000
  O             -2.26500000 +1    6.0880000 +1    4.6350000 +1                  0.0000
  H             -2.29500000 +1    6.0330000 +1    5.4940000 +1                  0.0000
 Al             -5.21500000 +1    9.2340000 +1    3.6720000 +1                  0.0000
 Al              2.02300000 +1    6.7250000 +1    3.6730000 +1                  0.0000
  O              3.29800000 +1    5.7360000 +1    4.7320000 +1                  0.0000
  O              0.52000000 +1    6.1770000 +1    4.6630000 +1                  0.0000
  O             -3.65900000 +1    8.7270000 +1    4.6870000 +1                  0.0000
  O              2.26800000 +1    8.2780000 +1    4.6710000 +1                  0.0000
  H              3.95600000 +1    6.0730000 +1    4.8530000 +1                  0.0000
  H              0.41500000 +1    6.1490000 +1    5.4940000 +1                  0.0000
  H             -3.58600000 +1    7.8560000 +1    4.6880000 +1                  0.0000
  H              2.23400000 +1    8.2470000 +1    5.5520000 +1                  0.0000
  O              2.13500000 +1    5.0970000 +1    2.6570000 +1                  0.0000
  H              1.48800000 +1    4.6770000 +1    2.6990000 +1                  0.0000
  O              3.43900000 +1    7.6020000 +1    2.6650000 +1                  0.0000
  H              3.46900000 +1    7.6570000 +1    1.8060000 +1                  0.0000
 Al             -2.29500000 +1    9.5340000 +1    3.6270000 +1                  0.0000
 Al              2.43200000 +1    6.6950000 +1   -1.2260000 +1                  0.0000
 Al             -4.80600000 +1    4.1860000 +1   -1.2270000 +1                  0.0000
  O              2.60300000 +1    8.2750000 +1   -2.2850000 +1                  0.0000
  O             -3.30300000 +1    3.6380000 +1   -2.2170000 +1                  0.0000
  O              0.87700000 +1    6.1880000 +1   -2.2400000 +1                  0.0000
  O              3.63400000 +1    5.7390000 +1   -2.2240000 +1                  0.0000
  H              1.94500000 +1    8.6120000 +1   -2.4070000 +1                  0.0000
  H             -3.19700000 +1    3.6100000 +1   -3.0470000 +1                  0.0000
  H              0.80300000 +1    5.3170000 +1   -2.2420000 +1                  0.0000
  H              3.66800000 +1    5.7080000 +1   -3.1060000 +1                  0.0000
  O              3.76700000 +1    7.6360000 +1   -0.2100000 +1                  0.0000
  H              4.41400000 +1    7.2160000 +1   -0.2520000 +1                  0.0000
  O              2.46300000 +1    5.0630000 +1   -0.2180000 +1                  0.0000
  H              2.43300000 +1    5.1180000 +1    0.6410000 +1                  0.0000
 Al             -0.48700000 +1    6.9950000 +1   -1.1810000 +1                  0.0000
 Al             -1.93300000 +1    4.4260000 +1   -1.1800000 +1                  0.0000
  O             -0.65800000 +1    5.4150000 +1   -0.1210000 +1                  0.0000
  O             -3.43600000 +1    4.9740000 +1   -0.1900000 +1                  0.0000
  O              1.06800000 +1    7.5020000 +1   -0.1670000 +1                  0.0000
  O             -1.68800000 +1    7.9510000 +1   -0.1820000 +1                  0.0000
  H             -3.54200000 +1    5.0020000 +1    0.6410000 +1                  0.0000
  H              1.14200000 +1    8.3730000 +1   -0.1650000 +1                  0.0000
  H             -1.72300000 +1    7.9820000 +1    0.6990000 +1                  0.0000
  O             -1.82100000 +1    6.0540000 +1   -2.1960000 +1                  0.0000
  H             -2.46900000 +1    6.4740000 +1   -2.1540000 +1                  0.0000
  O             -0.51700000 +1    8.6270000 +1   -2.1880000 +1                  0.0000
  H             -0.48700000 +1    8.5720000 +1   -3.0470000 +1                  0.0000
 Tv              0.77100000 +1    0.0000000 +1   -9.7060000 +1 
 Tv              0.00000000 +1   10.1560000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              8.68400000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(1,1,2) GNORM=5 GRADIENTS
      Gibbsite

  H         0.13413156 +1   -0.2573237 +1    0.0202315 +1                      0.0000
 Al        -0.79136010 +1    1.8164822 +1    3.4345401 +1                      0.0000
  O        -2.08447805 +1    2.7901898 +1    2.3531992 +1                      0.0000
  O         0.78151340 +1    2.4778593 +1    2.5543218 +1                      0.0000
  O        -3.79571668 +1    4.9993466 +1    2.2775689 +1                      0.0000
  O        -0.90254299 +1    0.2028039 +1    2.4104523 +1                      0.0000
  H        -2.94611063 +1    2.3127265 +1    2.2334942 +1                      0.0000
  H         0.78835199 +1    2.1370244 +1    1.5808595 +1                      0.0000
  H        -3.91838072 +1    5.9966618 +1    2.2722615 +1                      0.0000
  H        -1.20884538 +1    0.4109279 +1    1.4439430 +1                      0.0000
  O        -0.92556902 +1    3.5025432 +1    4.3808617 +1                      0.0000
  H        -0.03581442 +1    4.0039635 +1    4.2584690 +1                      0.0000
  O        -2.38841091 +1    0.9766534 +1    4.1879310 +1                      0.0000
  H        -2.32333801 +1    0.9026175 +1    5.2031251 +1                      0.0000
 Al        -5.30425753 +1    4.1259930 +1    3.1354338 +1                      0.0000
 Al         2.11926546 +1    1.5926206 +1    3.5735808 +1                      0.0000
  O         3.41154085 +1    0.6188414 +1    4.6526694 +1                      0.0000
  O         0.54507468 +1    0.9164050 +1    4.4483142 +1                      0.0000
  O        -3.77465692 +1    3.5686478 +1    4.2124475 +1                      0.0000
  O         2.22562232 +1    3.2053106 +1    4.6040841 +1                      0.0000
  H         4.27800274 +1    1.1012117 +1    4.7380644 +1                      0.0000
  H         0.53597441 +1    1.2173219 +1    5.4252290 +1                      0.0000
  H        -3.65109153 +1    2.5691167 +1    4.1869794 +1                      0.0000
  H         2.51516384 +1    3.0056729 +1    5.5702927 +1                      0.0000
  O         2.26031837 +1   -0.1000573 +1    2.6296258 +1                      0.0000
  H         1.36985916 +1   -0.5989657 +1    2.7358799 +1                      0.0000
  O         3.71395282 +1    2.4338506 +1    2.8240741 +1                      0.0000
  H         3.64416692 +1    2.5165196 +1    1.8035025 +1                      0.0000
 Al        -2.26726157 +1    4.4425871 +1    3.3638921 +1                      0.0000
 Al         2.47832359 +1    1.5794101 +1   -0.8724230 +1                      0.0000
 Al        -4.92661811 +1   -0.9926812 +1   -1.3400738 +1                      0.0000
  O         2.65226427 +1    3.2474118 +1   -1.8530371 +1                      0.0000
  O        -3.34391531 +1   -1.6503110 +1   -2.2117019 +1                      0.0000
  O         0.94888506 +1    1.0284189 +1   -1.9512411 +1                      0.0000
  O         3.83893565 +1    0.6541111 +1   -1.8041712 +1                      0.0000
  H         1.78315262 +1    3.7222156 +1   -1.9425762 +1                      0.0000
  H        -3.33183483 +1   -1.3426948 +1   -3.1875452 +1                      0.0000
  H         0.83033236 +1    0.0279097 +1   -1.9378870 +1                      0.0000
  H         3.55203979 +1    0.4650078 +1   -2.7725903 +1                      0.0000
  O         3.81486911 +1    2.5147837 +1    0.1607932 +1                      0.0000
  H         4.70771101 +1    2.0224244 +1    0.0401499 +1                      0.0000
  O         2.35660256 +1   -0.1490378 +1   -0.0327501 +1                      0.0000
  H         2.42895911 +1   -0.0730155 +1    0.9885655 +1                      0.0000
 Al        -0.55956784 +1    1.8827652 +1   -1.0818678 +1                      0.0000
 Al        -2.01587181 +1   -0.7546855 +1   -1.1832070 +1                      0.0000
  O        -0.73090818 +1    0.2161737 +1   -0.0908619 +1                      0.0000
  O        -3.59759752 +1   -0.0986987 +1   -0.3144581 +1                      0.0000
  O         0.96866751 +1    2.4290608 +1    0.0054079 +1                      0.0000
  O        -1.91253761 +1    2.8098900 +1   -0.1461253 +1                      0.0000
  H        -3.60880803 +1   -0.4278171 +1    0.6609179 +1                      0.0000
  H         1.08784861 +1    3.4265935 +1    0.0294527 +1                      0.0000
  H        -1.61030817 +1    3.0101985 +1    0.8238615 +1                      0.0000
  O        -1.89404573 +1    0.9465663 +1   -2.1088369 +1                      0.0000
  H        -2.78758719 +1    1.4401996 +1   -1.9754336 +1                      0.0000
  O        -0.43487696 +1    3.6140724 +1   -1.9206694 +1                      0.0000
  H        -0.50736965 +1    3.5417419 +1   -2.9358703 +1                      0.0000
  H         0.11156196 +1    4.9294581 +1    0.0602509 +1                      0.0000
 Al        -0.81195842 +1    7.0019241 +1    3.4716674 +1                      0.0000
  O        -2.10629240 +1    7.9727089 +1    2.3890977 +1                      0.0000
  O         0.76095552 +1    7.6666162 +1    2.5942744 +1                      0.0000
  O        -3.81690965 +1   10.1817019 +1    2.3102965 +1                      0.0000
  O        -0.91956588 +1    5.3907685 +1    2.4436397 +1                      0.0000
  H        -2.96930020 +1    7.4956130 +1    2.2746213 +1                      0.0000
  H         0.76785129 +1    7.3322011 +1    1.6189900 +1                      0.0000
  H        -3.93706967 +1   11.1794285 +1    2.3103421 +1                      0.0000
  H        -1.22560749 +1    5.6005725 +1    1.4760078 +1                      0.0000
  O        -0.94725955 +1    8.6899430 +1    4.4143960 +1                      0.0000
  H        -0.05675466 +1    9.1899047 +1    4.2910597 +1                      0.0000
  O        -2.41121956 +1    6.1631394 +1    4.2215072 +1                      0.0000
  H        -2.34770929 +1    6.0837431 +1    5.2361335 +1                      0.0000
 Al        -5.32986059 +1    9.3121161 +1    3.1673119 +1                      0.0000
 Al         2.09678988 +1    6.7756406 +1    3.6105176 +1                      0.0000
  O         3.39239519 +1    5.8039534 +1    4.6869341 +1                      0.0000
  O         0.52304416 +1    6.0999615 +1    4.4854087 +1                      0.0000
  O        -3.79769353 +1    8.7540334 +1    4.2436435 +1                      0.0000
  O         2.20437344 +1    8.3888040 +1    4.6405450 +1                      0.0000
  H         4.25784060 +1    6.2883062 +1    4.7705811 +1                      0.0000
  H         0.51462531 +1    6.4000566 +1    5.4632383 +1                      0.0000
  H        -3.67380350 +1    7.7545542 +1    4.2214941 +1                      0.0000
  H         2.49645107 +1    8.1873005 +1    5.6054705 +1                      0.0000
  O         2.23517894 +1    5.0865269 +1    2.6620617 +1                      0.0000
  H         1.34697984 +1    4.5836589 +1    2.7712674 +1                      0.0000
  O         3.69034647 +1    7.6179652 +1    2.8586444 +1                      0.0000
  H         3.62008563 +1    7.7021647 +1    1.8377848 +1                      0.0000
 Al        -2.28735143 +1    9.6281222 +1    3.3940801 +1                      0.0000
 Al         2.45424457 +1    6.7636976 +1   -0.8354147 +1                      0.0000
 Al        -4.94807958 +1    4.1949639 +1   -1.3100365 +1                      0.0000
  O         2.62861828 +1    8.4306683 +1   -1.8180853 +1                      0.0000
  O        -3.36480754 +1    3.5335909 +1   -2.1813887 +1                      0.0000
  O         0.92457092 +1    6.2135201 +1   -1.9146329 +1                      0.0000
  O         3.81832096 +1    5.8433381 +1   -1.7677473 +1                      0.0000
  H         1.75948573 +1    8.9068941 +1   -1.9043060 +1                      0.0000
  H        -3.35236827 +1    3.8390262 +1   -3.1564726 +1                      0.0000
  H         0.80564999 +1    5.2126526 +1   -1.9037312 +1                      0.0000
  H         3.53450196 +1    5.6545344 +1   -2.7371668 +1                      0.0000
  O         3.78994684 +1    7.7040671 +1    0.1946241 +1                      0.0000
  H         4.68218843 +1    7.2090816 +1    0.0775884 +1                      0.0000
  O         2.33465944 +1    5.0344537 +1    0.0016751 +1                      0.0000
  H         2.40789487 +1    5.1091103 +1    1.0230484 +1                      0.0000
 Al        -0.58487417 +1    7.0679832 +1   -1.0452511 +1                      0.0000
 Al        -2.03623019 +1    4.4311485 +1   -1.1537824 +1                      0.0000
  O        -0.75365048 +1    5.4012407 +1   -0.0547898 +1                      0.0000
  O        -3.61819708 +1    5.0834970 +1   -0.2818686 +1                      0.0000
  O         0.94437562 +1    7.6143922 +1    0.0406288 +1                      0.0000
  O        -1.93958464 +1    7.9986831 +1   -0.1160473 +1                      0.0000
  H        -3.62804038 +1    4.7469403 +1    0.6916882 +1                      0.0000
  H         1.06447319 +1    8.6119666 +1    0.0598179 +1                      0.0000
  H        -1.64128625 +1    8.1971390 +1    0.8548232 +1                      0.0000
  O        -1.91791713 +1    6.1318652 +1   -2.0741921 +1                      0.0000
  H        -2.81261789 +1    6.6224971 +1   -1.9381126 +1                      0.0000
  O        -0.45761828 +1    8.7984142 +1   -1.8862622 +1                      0.0000
  H        -0.52688509 +1    8.7252313 +1   -2.9013584 +1                      0.0000
 Tv         0.55882885 +1    0.0542657 +1   -9.0183887 +1 
 Tv        -0.04220708 +1   10.3764958 +1    0.0536114 +1 
 Tv         8.88532607 +1    0.0231108 +1    0.5481713 +1